ההתנצרות של היקים היא שאפשרה לדתיים להתפשט בשנת 1609, וחדרה לשטח סונורה.
במהלך המושבה סונורה התכתבה רק למורדות סיירה מאדרה אוקסידנטל הכלולים בגבולות אותה ישות. האזור שרץ צפונה מנהר יאקווי, כולל ריאל דה לה סינגווילה, נקרא פיימריה באחה והאזור הצפוני ביותר מאותו ריאל עד נהר קולורדו - כבר במדינת אריזונה בצפון אמריקה הנוכחית - נקרא פיימריה אלטה.
השטח הנוכחי של סונורן כולל גם אזור קטן בדרום מערב מה שהיה ידוע אז בשם פימריה, הממוקם במדינת צ'יוואווה ואוסטימורי, מקום שנמצא על חופי מפרץ קליפורניה, בין הנהרות מאיו ויאקי.
בשנת 1614 המיסיונרים פרז דה ריבאס ופדרו מנדז נוצרו את בני המאיה באזור אוסטימורי, וחילקו את המשימה לשלושה מחוזות: סנטה קרוז (בפתח מאיו), נבוג'ואה וטסיה.
הטפאונים שולבו יחד עם קורניקריס בשנת 1620. האב מיגל גודינז ייסד את משימותיהם של סן אנדרס דה קורניקארי ואסוניון דה טפאהוי. . באותה שנה נוסדה הרקטורה של סן איגנסיו, שכללה בנוסף לחמש המשימות שהוזכרו לעיל, אלו של באקום, טורין ורהון, הממוקמות בפתח יאקי.
בשנת 1617 הומרו ה יאקים על ידי ההורים פרז דה ריבאס ותומאס בזיליו. למרות התקוממויות, הפרות סדר, ייסורים ורצח, גיורם של סונורה היה מהיר ובטוח יותר. עד המאה ה -17 התרחבו הישועים וייסדו את המשימה של מייקובה ויקורה בחלק הדרום-מערבי של מה שהם מכירים כיניפס.
המשימות מנהר יאקי לצפון חולקו לארבע מחלקות: זו של סן בורג'ה קיבצה את המשימות של: קוקומאריפה וטקוריפה. , נוסד בשנת 1619; מובאס ואונובאס, בשנת 1622; Sahuaripa בשנת 1627; Matape בשנת 1629; Onapa בשנת 1677 ו Arivechi , בשנת 1727. הרקטורט של שלושת האנוסים הקדושים של יפן שכלל את באטוקו שהוקמה בשנת 1627, אופוסורה בשנת 1640 ובקדגואצ'י , גואזאבות , סנטה מריה באסראקה וסן מיגל בוויספה , נוסד בשנת 1645. והרקטורט של סן חאבייר ששילב את משימות אורס בשנת 1636; Aconchi, Opodepe and Banámichi בשנת 1639; קוקורפה ואריזפה בשנת 1648, וקואקיאארחי בשנת 1655.
בשנת 1687 נכנס המיסיונר אוסביו פרנסיסקו קינו לפימריה אלטה והחל במשימות הרקטורט של נואסטרה סניורה דה לוס דולורס, והקים: Caborca, שאליו הוקצה פרנסיסקו חאבייר סאטה המקיים התכתבות עם תמיכתו הרוחנית, האב. קינו; אטיל, טובוטאמה, גבירתנו של צער דה סאריק, פיטיקיטו, אייייל, אוקיטואה, מגדלנה, סן איגנסיו, קוקוספרה ואימוריס.
לאחר גירוש הישועים נותרו המשימות אחראיות על הפרנציסקנים, שלא בנו יותר ורק הגבילו עצמם לנסות לשמר את הקיימים. לאחר שהישועים כבר הקימו התנחלויות בסינאלואה וסונורה, הם הפנו את עיניהם לשטח קליפורניה.
